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分子育種

SNP變異檢測

  • 通过二代重测序技术对样本全基因组范围进行测序MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,通过和参考基因组比对和變異檢測獲取分布于全基因組的SNP標記vsport-(中国区)官方网站,並統計SNP密度MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。

群體遺傳結構分析

  • 根據不同品種/群體間的遺傳差異構建系統進化樹並進行PCA分析K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,對樣本進行聚類MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网vsport-(中国区)官方网站,揭示不同群體間的遺傳背景相似度、及基因交流情況PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站。

群體遺傳多樣性分析

  • 通過分析群體的雜合度(Ho、He)、核苷酸多樣性(π)、近交系數(Fis、Fit)及連續同源區(ROH)等指標PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版kg体育·(中国China)官方网站,判斷群體近交程度、雜合度和分化程度XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,可以評價保種群體狀態vsport-(中国区)官方网站,梳理樣本親緣關系MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,指導保種工作vsport-(中国区)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,也可對核心種質群體的遺傳背景進行評估kg体育·(中国China)官方网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。

核心種質分析

  • 核心种质是种质资源的的一个核心子集vsport-(中国区)官方网站kg体育·(中国China)官方网站XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,以最少数量的遗传资源最大限度地代表原有样本的表型、地理来源、遗传多样性等MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,一般选择10%样品组成PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。使用Corehunter软件EN算法计算MR(Modified Roger's distance)参数MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网kg体育·(中国China)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,可结合遗传多样性、地理来源和表型数据进行核心种质的筛选XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。分别对原群体和筛选后核心群体进行遗传多样性分析PA视讯(中国区)官网 - PlayAceB·体育-运动(B - Sports)体育官方网站kg体育·(中国China)官方网站,比较杂合度、近交系数等指标对核心种质合集进行评估XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。

親緣關系分析

  • 親緣關系系數(IBS)指群體中兩個個體間擁有共同祖先同源基因的概率Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com。把上下代個體間和同世代個體間的親緣關系稱爲親緣相關或血緣相關PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站。系數越高說明兩個個體間的親緣關系越近vsport-(中国区)官方网站HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来。基于IBS分析結果可制作如下的樣本間親緣關系熱圖:

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