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定量蛋白質組

iTRAQ/TMT

Deep DIA定量蛋白質組学

Deep DIA定量蛋白質組学是基于Astral質譜平台的全新一代direct DIA技术尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，通过数据非依赖采集扫描模式进行差异定量蛋白質組学分析杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版，窄窗DIA是一种超快速的定量分析方法XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户，可以进行全面的蛋白质组分析K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发，测序深度高意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发。它将四极轨道捕捉质谱仪与Astral质谱仪相结合龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOMEK8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户，可实现高扫描速度、分辨率、灵敏度和低 ppm 质量精度 ^[1]意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发。这种方法可以每天分析多达 100 个全酵母蛋白组或在短短半小时内分析大约 10,000 个人类蛋白质 ^[2]杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。深度与下一代 RNA 测序相当熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，并且与当前最先进的 MS ^[3] 相比官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，通量提高了 10 倍beat365中文官方网站[官网]-正版App Store。此外beat365中文官方网站[官网]-正版App Store，窄窗DIA具有很高的定量精度和准确性意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站，如在半小时内单次量化14,000多种蛋白质所示 ^[4]娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户。

圖1^[1].基于Astral 质谱平台的direct DIA簡介

技術原理

数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式^[1]熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户。可以依据质荷比（m/z）将质谱整个扫描范围分为若干个窗口杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，然后对每个窗口中的所有母离子进行碎裂、检测娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量beat365中文官方网站[官网]-正版App Store。目前流行的蛋白质组学研究手段龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心，如iTRAQ/TMT、Label-free、SILAC采用的都是数据依赖性的扫描模式(Data-dependent acquisition, DDA)K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心，一级质谱进行全扫描采集母离子信号生成一级谱图K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，二级质谱依次选择一级谱图中信号强度排序为top10/20/40的峰进行碎裂并采集对应的子离子信息beat365中文官方网站[官网]-正版App Store娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户。

Astral質譜平台

Orbitrap Astral 高分辨质谱仪共包含三个质量分析器：用于选择母离子的四极杆质量分析器、用于采集高动态范围HRAM谱图的 Orbitrap 质量分析器以及能够以高灵敏度和高达200Hz的速度采集高动态范围HRAM谱图的全新 Astral 质量分析器娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。这些质量分析器的独特优势相结合K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发，最大限度提升了解决方案的性能和可用性

图2. Astral 质谱仪簡介

技術優勢

相對于DDAXC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，DIA優勢體現在：
(1)采集一级质谱full scan的全部母离子及对应的二级质谱子离子信息杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，具有更高的数据覆盖度；
(2)二級質譜分“窗口”進行數據采集龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOMEXC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站，減少數據采集的隨機性娱乐中心—注册大厅（官网）娱乐中心 -我的账户官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心beat365中文官方网站[官网]-正版App Store，具有更高的檢測重現性和穩定性熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，適用于大批量樣品的蛋白質組學分析；
(3)依靠多個循環的多個子離子對蛋白質進行定量熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，定量精密度、准確性、線性範圍大大提高；
(4)使用内标校正肽段（iRT KIT)对不同样品的保留时间进行校正beat365中文官方网站[官网]-正版App Store，可对不同批次的样品进行蛋白定量分析

技術路線

分析流程

參考文獻

[1].Ulises, H, Guzmán., Ana, Martinez, Del, Val., Zilu, Ye., Eugen, Damoc., Tabiwang, N., Arrey., Anna, Pashkova., Eduard, Denisov., Ole, ?stergaard., Hamish, Stewart., Yue, Xuan., Alexander, Makarov., Vlad, Zabrouskov., Jesper, V., Olsen. Narrow-window DIA: Ultra-fast quantitative analysis of comprehensive proteomes with high sequencing depth. bioRxiv, (2023).
[2].Joerg, Doellinger. Increasing Proteome Depth While Maintaining Quantitative Precision in Short-Gradient Data-Independent Acquisition Proteomics. Journal of Proteome Research, (2023).
[3].Wenxue, Li., Hao, Chi., Barbora, Salovska., Barbora, Salovska., Chongde, Wu., Liangliang, Sun., George, Rosenberger., Yansheng, Liu. Assessing the Relationship Between Mass Window Width and Retention Time Scheduling on Protein Coverage for Data-Independent Acquisition. Journal of the American Society for Mass Spectrometry, (2019)
[4].Kyung, Cho, Cho., David, J., Clark., Michael, Schnaubelt., Guo, Ci, Teo., Felipe, da, Veiga, Leprevost., William, Bocik., Emily, S., Boja., Tara, Hiltke., Alexey, I., Nesvizhskii., Hui, Zhang. Deep Proteomics Using Two Dimensional Data Independent Acquisition Mass Spectrometry.. Analytical Chemistry, (2020).