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Hi-C測序

意昂体育app下载安装官网

Dynamic chromatin architecture of the porcine adipose tissues with weight gain and loss

期刊：Nature Communications
影響因子：17.694
发表单位：四川农业大学
測序产品：HiC、泛基因组、 RNA-seq 、ChIP-seq 、比较基因组
研究意义：结果为深入解析猪脂肪性状形成的分子机理、利用分子育種技术改良脂肪性状进而培育优质高效猪新品种提供了重要数据和理论支撑熊猫体育app下载安装（China）认证体育赛事直播平台沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。

一、研究思路

二、研究結論

1. 区室重排/TAD重构调控基因表达
差异TAD可能引起了基因启动子与调控元件间不同的相互作用杏宇娱乐-杏宇注册登录平台，进而影响了基因表达； ULB中特定存在的TAD边界引起了成脂相关基因EN1高表达（图2i）CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网EON4凯捷-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」，GOM中特定缺失的TAD则促进了促炎基因TCF21高表达（图2j）；
2. 远端增强子-启动子互作PEIs定位调控靶基因
根据PRS与增强子活性分布进一步定位炎症相关基因簇杏宇娱乐-杏宇注册登录平台沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」，WL （减重后）仍保有WG组（增重组）的高RPS以及高表达炎症基因簇XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站，说明猪部分炎症相关基因存在典型的“肥胖记忆效应” XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」。

案例二 Hi-C多组学技术揭示染色质三维结构与表观重塑促进干细胞命运转变

Lineage-specific rearrangement of chromatin loops and epigenomic features during adipocytes and osteoblasts commitment

期刊：Cell Death & Differentiation
影響因子：12.067
測序产品：HiC、 RNA-seq 、ChIP-seq 、ATAC-seq
發表單位：西安交通大學

一、研究思路

二、研究結論

1. Hi-C&RNA&ChIP多组学：特异增强子与loop联合对hMSCs分化的影响
分化前後互作/A/B、TAD、loop三維結構存在特異性變化；該過程伴隨著增強子的重塑熊猫体育app下载安装（China）认证体育赛事直播平台杏宇娱乐-杏宇注册登录平台，進而影響相關基因的特異性激活球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播。
2. Hi-C&ATAC&RNA多组学：染色质开放性、TF与基因表达、三维结构影响hMSCs分化
染色質開放性研究揭示特異性TFs開放域傾向于富集在特異性loop中,大部分上調基因的peak與H3K27ac修飾、更高的Hi-C接觸密度顯著相關杏宇娱乐-杏宇注册登录平台。