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微生物基因組重測序

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The genomic and phenotypic diversity of Schizosaccharomyces pombe

期刊：Nature genetics
影響因子：29.352
研究单位：Department of Genetics, Evolution and Environment, University College London
發表年份：2015年2月

一、研究背景

裂解酵母（Schizosaccharomyces prombe）是真核生物研究中的重要模式生物熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，但是对于这个菌株的进化历史熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，还没有系统的研究熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。作者汇集了100年内收集到的161株野生裂解酵母LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，通过重測序的手段PA视讯(中国区)官网 - PlayAceHOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」，多角度深入挖掘了酵母的进化相关信息PA视讯(中国区)官网 - PlayAce，特别是在地理分布、驯化起源、及表型关联方面获得了突破性的进展login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。

二、方法流程

取材

建庫

測序

分析

100年時間內收集到的161株野
生裂解酵母菌株

構建小片段文庫

PE54/PE100測序 ≥30X

1. SNP及InDel检测
2. 基因型多样性分析
3. 重组及连锁不平衡分析
4. 群体结构分析
5. 进化及起源节点估计
6. 全基因組關聯分析

三、研究結果

1. PCA分析
以752個非連鎖的SNP位點基因型信息爲基礎進行PCA分析熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，結果顯示MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，裂解酵母的變異基因型和采樣的地理位置不存在強相關性熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」。
2. 裂解酵母的进化时间
利用SNP作爲標記LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，結合采樣時間熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，推測酵母菌馴化起源MG不朽情缘·(中国版区)官方网站PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。根據推算得到的裂解酵母預期馴化起源時間熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，大致和希臘文明、漢文明等古文明時期相吻合（下圖）HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」。
3. 变异与性状的相关性
對全基因組進行關聯分析熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，在總計223個性狀中PA视讯(中国区)官网 - PlayAceMG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长，發現89個性狀與具體的變異信息存在顯著關聯HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。

四、研究結論

依托大规模真菌样本的重測序和进化研究意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSXC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长，是了解真菌进化史、传播规律意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSXC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站，区分真菌的致病机制熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，解读真菌基因型与表型间关联的有效手段PA视讯(中国区)官网 - PlayAceMG不朽情缘·(中国版区)官方网站。这篇裂解酵母群体研究的文章MG不朽情缘·(中国版区)官方网站，作为的真菌群体研究范本MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长，对于真菌大规模測序数据挖掘HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长，有着重要的指导意义熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站。