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微生物基因組重測序

變異檢測

變異檢測主要是在全基因组水平上检测SNP、InDel、SV及CNV这些变异MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站，并对其进行分析PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌。諾禾致源提供WGS-seq Reads在基因组上比对结果的bam格式文件熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTSPG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌，部分物种还提供相应的参考基因组和注释文件球客岛-足球篮球赛事直播平台，并推荐使用IGV (Integrative Genomics Viewer) 浏览器对bam文件进行可视化浏览九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌。

測序及比對質控

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SNP檢測及注釋（以SNP爲例）

基因組不同區域上SNP數目（左）和編碼區上不同類型的SNP數目（右）分布

SNP突變頻譜

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變異檢測结果可视化

爲了形象化展示樣本中的結構變異U8国际·[China]有限公司官网，對數據做如下處理：
(1) 对于SNP和InDel尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，画出其在染色体上的密度分布；
(2) 对于SV及CNVU8国际·[股份]有限公司官网球客岛-足球篮球赛事直播平台U8国际·[China]有限公司官网，画出它们在染色体上的位置；

爲了更清晰的顯示各染色體上SNP和InDel的分布情況球客岛-足球篮球赛事直播平台U8国际·[股份]有限公司官网，繪制染色體上的SNP、InDel密度分布熱圖

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染色体上密度分布热图以100kb为窗口PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站，统计每个窗口上的InDel密度